《三阴性乳腺癌的基因组和转录组：亚型和治疗策略》

三阴性乳腺癌是乳腺癌中恶性程度最高的一种，并且目前三阴性乳腺癌只能依靠化疗，并且治疗效果不佳，这是乳腺癌学界的一道世界性难题。越来越多的研究表明，三阴性乳腺癌可能并不是单一的类型，其有哪些亚型，在此前国际上所有的三阴性乳腺癌研究课题中都没有给出明确的答案。本研究旨在获得三阴性乳腺癌的基因图谱，进行分子分型，为精准治疗提供参考。

样本材料：360个三阴性乳腺癌肿 瘤组织样本
高通量测序：去除核糖体RNA测序，Illumina HiSeq平台
生信分析：无监督聚类分析；基因富集分析等。

使用无监督的k均值聚类方法将360个肿瘤分为4个独立的亚型：免疫调节型（IM）、腔面雄激素受体型（LAR）、基底样免疫抑制型（BLIS）、间质型（MES）。

图2 mRNA亚型的表达热图

基于mRNA的TNBC的亚型分类对TCGA数据进行分析，与TCGA的TNBC患者相比，中国患者的LAR亚型患病率较高（23%）。

图3 中国和TCGA中的三阴性乳腺癌的mRNA亚型的分布

将4种mRNA亚型结合淋巴结状态和肿瘤大小进行预后分析，结果显示IM相对于BLIS有明显更好的预后（风险比：0.34; 95％置信区间：0.13-0.85; p = 0.021）。

图4 中国和TCGA中的三阴性乳腺癌的mRNA亚型的分布

中国三阴性乳腺癌分为4种类型，IM、LAR、BLIS、MES。这是国际上首次基于多维大数据系统提出的三阴性乳腺癌分类标准，这为寻找到三阴性乳腺癌的靶点指明了新的方向。

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